刘裕的弟弟刘道规自出道以来，还没有立过什么象样的战功，如果不敲打一下桓玄，以后哥哥那里都不好给自己杆子爬。刘道规不同意退兵：“桓玄的强大只是表面上的，桓玄志大才疏，胆怯如鸡，乌合虽众，不足一扫。闻桓玄在大舰旁系有小舟，以便败时逃跑，如此怯弱，三军谁肯用命？两军决战，胜负之间，尽在主将雄怯与否，汉光武破昆阳，魏武克官渡，都是以寡制众，彼能行之，我何不可！”刘道规不愧是刘寄奴的弟弟，够英雄。
刘毅觉得也是如此，便下令进击楚军，江上突然起大风，晋军一把大火烧过去，万箭齐发，楚军大败而逃，桓玄果然跳上小舟，带着可怜的司马德宗窜回江陵。说来也是巧合，晋朝有两个史上著名的白痴皇帝，而且都非常苦命（痴呆不是他们的错），晋惠帝司马衷在八王之乱时被人当宝贝一样抢来抢去，司马德宗也是这样。做了十几年的皇帝，一天好日子没享过，最终都被人害死，这也是司马家的气数吧。桓玄打仗不怎么样，逃跑的功夫倒是一流，见江陵也不是个安稳之地，打算去投奔梁州刺史桓希。桓玄屡战屡败，人心丧尽，桓玄不从部下冯该的苦劝，出城北逃。他的手下见桓玄果不是个成大事的，都起了二心，不知道是谁乱中冲着桓玄就砍，可惜没砍到，桓玄吓的连滚带爬的逃到船上，没来得及带上司马德宗，自己轻舟窜去。
桓玄的屯骑校尉毛修之是益州刺史毛璩的侄子，毛修之知道桓玄人头的价值，想把桓玄骗到蜀中，一刀给废了，夺取首功。桓玄真上了当，轻舟直进至枚回洲，没想到遇上了毛璩的侄孙毛祐之，毛祐之大喜，天下掉下块大肥肉，不吃那是傻子，下令放箭，射死这个国贼。桓玄不备，被射中一箭，还没等桓玄叫痛，益州督护冯迁就已经跳上了桓玄的船。死到临头了，桓玄还不忘摆谱：“你是什么人？敢弑天子！”冯迁大笑：“你这忘恩负义的贼！今日迁将为天下除害！”一刀干掉了桓玄，桓玄死时三十六岁。
桓玄做为一个失败者，在历史自然得不到好的评价，《晋书》对桓玄毫不客气：“得据全楚之地，驱劲勇之兵，因晋政之陵迟，乘会稽之酗，纵其狙诈之计，扇其陵暴之心，敢率犬羊，称兵内侮。”随后《晋书》又谈了对成功者的看法：“夫帝王者，功高宇内，道济含灵，龙宫凤历表其祥，彤云玄石呈其瑞，然后光临大宝，克享鸿名，允彳奚后之心，副乐推之望。”这些称赞明显是在说刘裕，最后取笑桓玄：“干纪乱常，倾宗绝嗣，肇金行之祸难，成宋氏之驱除者乎！”这倒是大实话，刘裕之所以最后能成大家，自建宋朝，最根本的动力便是桓玄，孙恩都排不上号。
桓玄虽然做了古，但桓家的余孽们还能蹦达几天，桓谦和桓振趁着江上起风，晋军无法前行的时机，又盘踞了江陵。刘毅留在巴陵（今湖南岳阳），何无忌与刘道规继续西进，何无忌没有听从刘道规的劝告，贸然进攻，被楚军败了一阵。随后晋军再战，刘毅出马对付鲁城的孟山图，何无忌与刘道规对付偃月垒的桓仙客。楚军早就成了惊弓之鸟，一打既散，活擒楚将。晋军乘胜进击，直迫马头（今湖北江陵南），同时南阳太守鲁宗之也向朝廷反正，出兵攻江陵，已经行至纪南城（江陵北），楚军大乱。晋军士气极盛，一鼓作气，攻下江陵，桓谦逃走。江陵是桓氏经营几十年的老巢，得到江陵，也宣告桓氏家族的彻底衰亡。何无忌奉命护卫皇帝司马德宗还建康，桓玄之乱，终被扑灭。
这次破江陵，功劳最大的应该是刘道规，刘道规为人谦逊，自居功末，请让刘毅为首功，何无忌为次功。刘道规之所以让功，还有一种可能，就是他觉得哥哥在京师立足未稳，人心未必尽服，如果现在就把自己立为首功，怕被别人说闲话，影响哥哥的前途，要知道，刘裕的前途就是他刘道规的前途。随后朝廷就有诏下来，封刘道规为荆州刺史，刘道规得了彩头，那是靠自己真刀真枪拼出来的，史载刘道规镇荆期间，“善于为治，刑政明理，士民莫不畏而爱之。”刘裕有这样一个英雄弟弟，再加上刘穆之在旁辅佐，刘裕便无后顾之忧，这时的刘裕，已经成了晋朝头一号的军阀，晋朝实际上的最高统治者。
